В последнее лето XX века люди узнали, что планета им больше не принадлежит. Гигантские чудовища выбрались из земных недр и начали уничтожать человеческие города и друг друга. Самым страшным из кайдзю был Годзилла — непобедимый ящер с радиоактивным дыханием.
Человечество решает оставить Землю и отправиться на поиски нового дома. Через 20 лет космического путешествия становится очевидно — вероятность найти пригодную для жизни планету ничтожно мала. Харуто было 4 года, когда он попал на корабль переселенцев, и теперь парень считает, что человечество позорно сдалось — нужно было всеми силами отстаивать Землю и сражаться с Годзиллой. Его идеи становятся популярны, и принято решение вернуться. Из-за использования технологии гиперскачка в пространстве переселенцы возвращаются на Землю через 20 000 лет после собственного бегства. От цивилизации не осталось и следа, миром правят чудовища, а на вершине пищевой цепочки восседает враг человечества — Годзилла. Последнее лето XX века изменило всё. Именно тогда люди узнали, что они не единственные хозяева на планете Земля — огромные монстры, впоследствии названные кайдзю (яп. 怪獣, «монстры»), стали наполнять её.Одним из таких монстров была Годзилла. После войны длинной в полвека люди окончательно проиграли кайдзю. Поражение от врага, в несколько раз превышающего человека как в размерах, так и в единицах, вынуждает человечество покинуть Землю.Люди отправились на Тау Кита, планету, что находится на расстоянии в 11,9 световых лет от Земли. Однако, после 20-летнего путешествия на корабле «Арарат» оказалось, что среда Кита далека от прогнозов и не подходит для обитания живых существ.Главный герой, Харуо Сакаки, на глазах которого Годзилла убила родителей, желает расправиться с кайдзю. Невозможность эмиграции и ухудшение условий жизни на корабле стали поводом для создания фракции «Возвращение Земли», во главе с Харуо Её члены желают вернуться на Землю. Но за время отсутствия людей Земля стала совсем другим миром с неизвестной экосистемой, которым правят кайдзю.